Ka rreth 500 lloje të ndryshme peshkaqenësh në botë, dhe ata jetojnë në të gjitha oqeanet e Tokës. Peshkaqenët e parë evoluan më shumë se 400 milionë vjet më parë, por ata aktualisht janë në një problem të vogël. Numri i shumë specieve është ulur, dhe rreth 100 milionë peshkaqenë kapen dhe vriten çdo vit nga peshkimi.
Megjithëse kafshimet e paprovokuara të peshkaqenëve janë në rritje në mbarë globin, vetëm disa lloje peshkaqenësh janë në të vërtetë të rrezikshëm për njerëzit – peshkaqenët e demave, të bardhët e mëdhenj dhe peshkaqenë tigër janë ata që kanë më shumë gjasa të sulmojnë njerëzit. Thënë kështu, një person mesatarisht ka më shumë gjasa të vdesë nga një goditje rrufeje sesa të kafshohet nga një peshkaqen, sipas Dosjes Ndërkombëtare të Sulmit të Peshkaqenëve të Muzeut të Floridës (e vetmja bazë e të dhënave e mbledhur shkencërisht në botë për ndërveprimet njeri-peshaqen).
Peshkaqenët banojnë në të pesë oqeanet e botës – Atlantik, Paqësor, Indian, Arktik dhe Jugor – dhe gjenden në ujërat e cekëta bregdetare deri në pjesët më të thella, më të errëta dhe më të ftohta të deteve të hapura. Ato janë të zakonshme deri në thellësi rreth 2000 m, por është jashtëzakonisht e rrallë të gjesh peshkaqenë nën 3000 m.
Ndërsa specie të caktuara peshkaqenësh preferojnë mjedise specifike detare – tigrat, kokat e çekiçit dhe peshkaqenët e demit preferojnë ujërat tropikale, peshkaqeni i Grenlandës dhe peshkaqeni goblin zgjedhin ujin e ftohtë dhe peshkaqenët mako, shirës dhe peshkaqenë kanë një preferencë për ujërat e butë – peshkaqenët nuk janë territorial nga natyra, kështu që ata do të ndryshojnë shpesh habitatin e tyre në kërkim të ushqimit.
Disa peshkaqenë migrojnë mijëra milje çdo vit, duke përfshirë një peshkaqen balenë të quajtur Anne që u etiketua dhe u gjurmua gjatë 841 ditëve nga brigjet e Panamasë deri në kanalin Marianas në jug të Japonisë (llogore më e thellë oqeanike në Tokë), një distancë prej mbi 12,500 miljesh. .
Shumica dërrmuese e specieve të peshkaqenëve jetojnë në ujërat e kripur me fuqi të plotë. Ka disa peshkaqenë bregdetarë që mund të mbijetojnë në ujërat e njelmët dhe këto habitate të peshkaqenëve përdoren nga të vegjlit e vegjël si çerdhe. Megjithatë ka vetëm disa peshkaqenë – të njohur si diadromë – të cilët mund të mbijetojnë për çdo kohë në ujërat e ëmbla.
Peshkaqeni dem është peshkaqeni diadromë më i njohur dhe është përshtatur me një gamë të gjerë të kripësisë së ujit. Ka popullata të mëdha të peshkaqenëve të demave në lumenjtë kryesorë të Australisë dhe, çuditërisht, disa u panë duke notuar në rrugët e përmbytura të Brisbane gjatë përmbytjeve të Queensland të vitit 2011. Ata janë gjetur gjithashtu mbi 2,000 milje lart në Amazon dhe 1,700 milje lart në Misisippi .
Peshkaqeni me dhëmbë shtize është kapur 60 milje lart në lumin Adelaide në Australi, por nuk ka popullsi që jetojnë në lumenj pa dalje në det, gjithmonë do të ketë një rrugë kthimi në oqean.
